Eptisa ha sido adjudicataria de tres importantes proyectos para desarrollar los estudios técnicos para la implantación de los Planes de Gestión del Riesgo de Inundación y desarrollo y mejora del Sistema Nacional de Cartografía de Zonas Inundables en medidas de la Dirección General del Agua en:
- La Confederación Hidrográfica del Cantábrico
- La Confederación Hidrográfica del Guadalquivir
- La Confederación Hidrográfica del Tajo (este proyecto en UTE con Typsa)
Con una duración de 36 meses en cada uno de los proyectos, el objeto principal de los trabajos es el desarrollo del tercer ciclo de la Directiva de Inundaciones, y de forma adicional la realización de otras actuaciones de interés general incluidas en los PGRI de 2.º ciclo. Todos estos trabajos se desarrollarán en el ámbito de las tres Confederaciones Hidrográficas 
Las principales actuaciones son las siguientes:
- Desarrollo del 3.er ciclo de la Directiva de Inundaciones
- Fase 1: Revisión de la Evaluación Preliminar del Riesgo de Inundación
- Fase 2: Revisión de los Mapas de Peligrosidad y Riesgo de Inundación
- Fase 3: Revisión y actualización de los Planes de Gestión del Riesgo de Inundación
- Otras actuaciones de interés general incluidas en los PGRI de 2.º ciclo
- Estudios de alternativas de actuaciones contra inundaciones
- Estudios coste-beneficio para obras de protección de inundaciones
- Redacción de proyectos recuperación ambiental y protección frente a inundaciones
- Generación de cartografía de zonas inundables
